剖宫产是解决难产等特殊情况下的一项应急性医疗措施，因此剖宫产有风险，手术中易出现麻醉意外、子宫异常出血、膀胱或输尿管损伤、心血管功能障碍等危及生命的现象。手术后易出现肠梗阻、产褥感染、产后出血等，其远期影响更容易被人忽略，有分析表明剖宫产后，母亲2年内再次怀孕易出现子宫破裂，产后5年内易出现宫外孕、消化不良和盆腔炎等，产后15年内易出现子宫内膜异位症、盆腔炎等。
剖宫产对孩子来说也有很多不良影响。剖宫产新生儿最容易出现湿肺，说通俗点，剖宫产就是直接把婴儿从羊水里拿出来，没有经过阴道的挤压，积在肺里的水就出不来。手术也可能造成新生儿产伤和骨折，新生儿肺透明膜病变，黄疸增加，免疫功能低下。其远期影响更为显著，孩子容易发生过敏性哮喘，剖宫产时产妇在麻醉状态下出现的低血压会造成胎儿缺氧，不利于新生儿脑功能发育。剖宫产术后最初几天，母亲会出现母乳不足而选择代乳品喂养孩子，这也将影响婴儿健康。
