对比传统疗法，干细胞疗法是近年来再生医学的核心技术，对诸多疾病具有修复调节的作用。
研究人员将其应用至改善慢性疲劳综合症的研究中，并总结了2大优势：
修复受损组织：干细胞对人体各组织具有强大的修复功能，可促进受损部位的细胞再生，增强内源性细胞活性；
调节组织微环境：干细胞通过旁/内分泌机制分泌各种细胞因子，发挥免疫调节和营养支持等作用，提高免疫力；
研究实验或临床试验来验证了干细胞疗法改善慢性疲劳综合症的效果及安全性，科研过程选用疲劳乏力、睡眠质量差这两个可量化的典型症状作为评估指标。
1.缓解疲劳
疲劳乏力是指机体生理过程不能持续其特定程度的功能或不能保持预定的运动强度，高强度劳动会产生乳酸和其他代谢产物，肌肉张力降低。
干细胞疗法可提高身体活力，及时清除体内有害物质，具有抗疲劳和抗缺氧能力的作用。
机体抗疲劳能力最直接、最重要的表现是运动耐力的提高，强迫游泳时间长短可以反映运动疲劳的程度。
研究发现，经过干细胞注射，与对照组相比有明显延长，且差异极显著；另外血乳酸、尿素氮和血氨的含量差异也有统计学意义，说明干细胞疗法能提高机体抗疲劳的耐力。
2.提高睡眠质量
睡眠质量差表现为入睡困难、睡眠不连贯、中途醒来后无法继续入睡（早醒），影响患者的生活质量。科研人员纳入了19例慢性失眠患者进行干细胞疗法的研究，另外20例作为对照组，这些患者原先采用其他方法治疗效果均不佳。试验中主要观察两组患者的SF-36生活质量评分和PSQI睡眠质量评分。
随访1年，干细胞疗法组患者的睡眠质量、睡眠障碍和日间功能障碍持续改善，且治疗后3个月生活质量评分明显好于对照组，并持续到随访结束，期间无明显不良反应。
干细胞疗法提高睡眠质量具有良好的效果。
