干细胞移植治疗肝硬化
2000年，日本学者Alison、Theise、Korbling等研究证实间充质干细胞（MSCs）具有向肝实质细胞分化的潜能。研究人员使用大鼠骨髓干细胞，加入不同浓度的HGF（干细胞生长因子）进行体外诱导培养后，发现骨髓干细胞可以分化为肝样细胞。干细移植在肝病治疗方面的临床研究证实，经干细胞治疗后的患者，其临床一般情况好转，肝功能改善。
我国2014年给10名肝衰竭患者注射了脐带间充质干细胞液体，七位患者的病情明显缓解。在我国科技人员的努力下，专治肝病的脐带间充质干细胞注射液已积累的200多例临床研究表明，其有效率达97%以上，以这项研究成果为基础的新药申请已进入到审批阶段。
MSCs来源的外泌体可以治疗心脏受损
间充质干细胞来源的外泌体携带和传送 mRNAs、miRNAs 和蛋白质到受损的心脏组织从而增强内源性心肌干细胞的激活 / 增殖、心肌细胞增殖、血管新生和心脏炎症反应的调控。
干细胞治疗为再生受损的心脏提供了巨大的希望，但已受其有效性、尚不清楚的机制、缺血环境中移植细胞的生存问题等诸多因素的阻碍。移植的干细胞存活率和整合率低，且难以向心血管细胞谱系分化，从而限制了其改善心功能的作用。各种提高干细胞疗法效果、克服细胞治疗各类问题的替代方法，已经取得了不同程度的成功。无细胞组分，如富含来源于分泌细胞的蛋白质、mRNAs、miRNAs的外泌体，是一种治疗心血管疾病的潜在方法。最近几年，不同种类的干细胞的外泌体已经被有效地用于改善病理心脏的心功能。
间充质干细胞来源的外泌体可调节细胞信号传导途径、递送表观遗传因子、促进细胞存活、增殖和血管生成，从而提高了内源性应对损伤的组织修复。
MSCs外秘体的无细胞治疗应用
最近，MSCs衍生的胞外囊泡（EV），包括外泌体和微泡（MV），正在考察其在MSCs细胞治疗中的作用。这些囊泡参与细胞间传递、细胞信号传导、以及在体内短距离或长距离处改变细胞或组织代谢。外泌体和微泡（MV）可以影响组织对损伤、感染和疾病的反应。MSCs衍生的外泌体具有包含细胞因子和生长因子、信号脂质、mRNA和调节miRNA的内容物。MSCs外泌体用于无细胞再生医学，很大程度上将取决于它们的生产的质量、重复性和效力，这些参数决定了基于细胞的MSCs治疗的发展。然而，MSCs外泌体的内容物不是静态的，与MSCs组织来源、活性和MSCs的直接细胞间邻居密切相关。因此，当MSC与肿瘤细胞一起培养或在体内肿瘤微环境中培养时，由MSCs产生的外泌体内含物似乎被改变。因此，仔细注意生产MSCs外泌体的细节可以为低风险的基于MSCs的无细胞治疗提供新的治疗范例。
间充质干细胞体外高效制造新生软骨
美国凯斯西储大学(Case Western Reserve University)研究人员发现，自组装的间充质干细胞层与填充满生长因子的微小珠子浸透在一起，要比以前的组织工程方法形成更加厚和更加硬的软骨。该研究成果已经发表在《控制释放期刊》(Journal of Controlled Release)杂志上。该研究是朝开发出可移植的软骨替换又走近了一步，并给治疗由于骨关节炎(osteoarthritis)、运动损伤和事故而遭受破坏的膝、肩、耳和鼻带来希望。
间充质干细胞在风湿领域的应用
间充质干细胞治疗在风湿病领域，也已得到了一些动物和人体研究的结果。向试验性狼疮性肾炎的模型小鼠输注人脐带血间充质干细胞能够延缓蛋白尿的发生，降低抗dsDNA水平，减轻肾脏损伤，且Th1细胞相关的细胞因子（IFN-γ，IL-2）及促炎症因子（TNF-α，IL-6，IL-12）水平下降而Th2细胞相关细胞因子（IL-4，IL-10）水平增加。在另一项研究中，向MPL/lpr小鼠输注人骨髓间充质干细胞，也观察到了类似的病情改善。
人体研究方面，智利的Carrion等用自体骨髓来源的间充质干细胞试验性治疗了2例系统性红斑狼疮患者，仅观察到了外周血CD4+CD25+FoxP3+细胞数量的增加，而疾病活动度无改善。
另外，其他风湿免疫病包括类风湿关节炎、血管炎、原发性胆汁性肝硬化等应用MSC也取得了相当不错的临床疗效，这些结果提示MSCs移植可能是自身免疫病治疗中一项很有希望的新疗法。
间充质干细胞的临床研究已经在许多国家开展，美国批准了40余项临床试验，随着间充质干细胞及其相关技术的日益成熟，我国也批准了多项临床研究，走入了间充质干细胞核心技术研发的舞台。我国已经大力加强干细胞研究工作的开展，对于间充质干细胞用于治疗十余种难治性疾病的治疗研究，除了用来促进恢复造血，与造血干细胞共移植提高白血病和难治性贫血等以外，还用于心脑血管疾病，肝硬化、骨和肌肉衰退性疾病、脑和脊髓神经损伤、老年痴呆及红斑狼疮和硬皮病等自身免疫性疾病的治疗研究，已经取得的部分临床研究结果令人鼓舞。
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