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abcam |【谣言粉碎机】别再盲目“煮样”了!条带变大、拖尾、弥散、无信号在等着你【靶点解惑】

abcam |【谣言粉碎机】别再盲目“煮样”了!条带变大、拖尾、弥散、无信号在等着你【靶点解惑】 睿捷生物
2024-05-23
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导读:做实验时常常会怀疑人生:明明已经按照实验室祖传标准流程一步步操作,但仍不是每一次都能够得到理想的结果!难道实

做实验时常常会怀疑人生:明明已经按照实验室祖传标准流程一步步操作,但仍不是每一次都能够得到理想的结果!难道实验室传承多年的protocol也有bug? 


太过相信标准流程,说不定就忽视了实验中“亿些”可以优化的要点! 


那么如何避免一条protocol走到黑?


Abcam打造全新内容板块,一期一篇专题内容,重点讲解热门应用WB, IHC在实际操作过程中如何避免 “刻板印象” ,让我们一起学习如何科学的根据靶标特性优化实验流程吧!


本期内容将重点讲解WB实验中,如何针对膜蛋白制样进行实验条件的优化!

蛋白质从细胞质到质膜的转运是信息传递的关键步骤,目前许多药物的靶点都是膜蛋白,这表明高效且正确检测膜蛋白的重要性。

然而,WB实验中检测膜蛋白时常常会遇到蛋白变大、拖尾、弥散、无信号等情况,有小道消息说这可能是高温煮样造成的,是真的吗?

通常情况下,煮样是WB实验流程中的一个必要步骤,将样本缓冲液中的细胞裂解液在100 °C 下煮沸5 分钟,能够帮助蛋白充分变性。难道通用的protocol并不适合膜蛋白的检测?

//Abcam谣言粉碎机,有图有真相!让我们一起查看内部验证结果,寻找真实答案吧!


煮样对膜蛋白检测的影响?



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案例一

图1:重组Anti-P Glycoprotein抗体[EPR10364-57] (👉🏻ab170904)

泳道1&3:使用 RIPA 裂解方法制备的 C6(大鼠胶质瘤胶质细胞)全细胞裂解液

泳道2&4:使用 1%SDS 热裂解法制备的 C6(大鼠胶质肿瘤胶质细胞)全细胞裂解液

预测条带大小:141 kDa

实观测条带大小:180 kDa

检测P Glycoprotein蛋白的WB实验中,对比了是否煮样,以及不同裂解液对实验结果的影响。从图片中可以非常明显的看出,煮样后出现了P Glycoprotein无信号的现象,说明了对于P Glycoprotein来说,不煮样是样本制备的关键步骤。同时,RIPA 裂解法和1%SDS 热裂解法在不煮样的情况下都能检测到蛋白条带,但相对来说RIPA 裂解法更适用一些。

案例二

图2:Anti-Glucose Transporter GLUT1 antibody [EPR3915] (👉🏻ab115730)。

泳道1:20 µg 未煮样的HT-29全细胞裂解液

泳道2:20 µg 煮样的HT-29全细胞裂解液

泳道3:20 µg 未煮样的3T3-L1全细胞裂解液

泳道4:20 µg 煮样的3T3-L1全细胞裂解液

预测条带大小:54 kDa

检测条带大小:40-60 kDa

其他:我们建议在裂解后不要煮沸样品。

检测GLUT1蛋白的WB实验中,对比了是否煮样,以及不同细胞样本对实验结果的影响。从图片中可以看出,煮样后GLUT1检测信号明显变弱,且HT-29细胞样本的蛋白条带拖尾现象更加明显。


所以,综上所述,煮样对于不同膜蛋白的影响是存在明显区别的,并不一定会完全导致信号消失,但有可能会对蛋白条带的迁移和抗体识别效果产生一定的影响。












高温影响膜蛋白检测的原因是?



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膜蛋白特殊的疏水结构,在高温状态下容易聚集形成二聚体或多聚体遮蔽抗原表位,使抗体无法正确识别,同时,这些聚集体在电泳时迁移速度缓慢,甚至会滞留在凝胶孔中无法迁移,导致检测时常常会出现蛋白变大、拖尾、弥散、无信号等现象。所以,从这些案例中可以更清楚的知道温度对于部分膜蛋白制备及检测的影响是极大的,传统的煮样方式并不一定适用于所有膜蛋白。







膜蛋白应该如何正确制样?



若检测的靶标蛋白为多次跨膜蛋白,且煮样后出现蛋白变大、拖尾、弥散、无信号等情况,建议尝试不煮样,可根据样本情况及靶标特性,梯度摸索最适合的孵育时间和温度。


同时,针对以下热门的膜蛋白靶标,小编总结了WB实验中的注意事项,快来看看除了“不煮样”,膜蛋白还有哪些需要注意的实验关键点吧!


点击靶标名称,可查看更多内容关于蛋白功能、特性、表达、定位、异构体及翻译后修饰,以及WB注意事项、阳性及阴性对照、关键控制点等信息!



 ABCA1

WB实验注意事项

• ABCA1,Phospholipid-transporting ATPase ABCA1(UniProt: O95477)为多次跨膜蛋白,高温煮样容易导致膜蛋白聚集。若煮样后出现蛋白变大、拖尾或无信号等现象,建议尝试裂解后不煮沸样品。


• 部分细胞系经过刺激诱导后靶标蛋白信号增强(例如:可使用20uM T0901317诱导HepG2细胞16小时),建议查阅产品说明书或文献确认刺激诱导条件。 


• ABCA1实际检测分子量大小约为260kDa,建议选择适用于大分子量蛋白检测的实验条件,例如,在WB实验中使用较低浓度的分离胶(如6~8%)进行电泳;转膜时,建议使用0.45μm的PVDF膜,转膜缓冲液中的甲醇含量可选择10%或更低浓度,同时加入SDS至终浓度为0.1%。



👉🏻CPT1A

WB实验注意事项

• CPT1A为多次跨膜蛋白,若煮样后出现条带分子量变大、模糊、拖尾等现象,建议尝试不煮样。


• CPT1A定位于线粒体外膜上,若全细胞裂解液检测信号弱,建议尝试提取线粒体组分增强检测信号。 


• CPT1A存在表达特性,在肝脏组织中表达量较低,若检测靶标蛋白含量较弱的样本(eg:HepG2,肝脏组织),建议增加上样量、降低抗体稀释比例提高检测信号,同时建议增加阳性对照。



👉🏻CXCR4

WB实验注意事项

• CXCR4为多次跨膜蛋白,高温煮样容易导致膜蛋白聚集。若煮样后出现蛋白变大、拖尾或无信号等现象,建议尝试裂解后不煮沸样品。


• 若全细胞裂解液检测信号弱,可尝试提取细胞膜组分富集靶标蛋白。


• 为避免磷酸化对CXCR4检测产生影响,我们建议在一抗孵育前使用λ蛋白磷酸酶处理膜。



👉🏻E Cadherin

WB实验注意事项

• E Cadherin是一个膜蛋白,在胞外区有许多钙粘蛋白的重复序列,可能遮蔽抗原表位,因此建议超声裂解以暴露抗原表位,便于抗体结合。 


• 在不同样品中可能检测到分子量约为80kDa,97kDa和120kDa的一条或多条条带。


• 不同组织或细胞中,E Cadherin表达量可能不同,建议设置阳性对照(例如HT-29细胞裂解液)。



👉🏻GLUT1

WB实验注意事项

• GLUT1存在糖基化修饰,实际检测分子量约40-60 kDa(预测分子量:54 kDa),可能存在多条条带现象。


• 我们不建议对裂解后的样本进行煮样。GLUT1为多次跨膜蛋白,高温煮样容易导致蛋白聚集,不能有效进入胶中,出现条带变大、模糊或拖尾等现象。


• 我们不建议对裂解后的样本进行煮样GLUT1为多次跨膜蛋白,高温煮样容易导致蛋白聚集,不能有效进入胶中,出现条带变大、模糊或拖尾等现象。



👉🏻Mannose Receptor

WB实验注意事项

• Mannose Receptor(CD206)主要在巨噬细胞和树突状细胞表达,也可在淋巴、肝和脾内皮、肾系膜细胞、气管平滑肌细胞和视网膜色素上皮中表达。建议选择表达量较高的样本作为阳性对照,例如肺。 


• Mannose Receptor(CD206)是一种预测约166 kDa的膜结合蛋白,煮样可能会引起蛋白聚集,若无信号,建议样本制备后不煮样。


• Mannose Receptor在大脑中的表达在生命的第一周达到最高,此后急剧下降,在整个成年期保持在低水平。因此在正常全脑裂解液中,很难检测到信号。 


• Mannose Receptor还有存在可溶性的形式,可溶性CD206存在于人树突状细胞、人巨噬细胞和小鼠巨噬细胞的培养基中,也存在于人和小鼠血清中。研究发现,CD206的可溶形式分子量比膜结合形式更小。 


• Mannose Receptor还存在翻译后修饰,例如糖基化修饰,因此实际检测分子量可能比预测分子量大。


• 在炎症反应过程中,IL-4和IL-13会刺激Mannose Receptor(CD206)表达会上调。对于部分细胞如RAW264.7,IL-4和IL-10处理会增加CD206的表达,因此刺激处理有利于解决WB实验时无信号或信号弱等问题。



👉🏻P Glycoprotein

WB实验注意事项

• P-糖蛋白多个位点存在糖基化修饰,可能影响蛋白条带的迁移。实际检测条带大小可能在160-200 kDa,而不是预测的141 kDa


• 由于蛋白糖基化的特点,通常会在膜上150-300 kDa位置出现模糊的拖带(如图3、4和5所示)。不建议裁膜,以防丢失目的条带。 


• 由于P-糖蛋白是多次跨膜蛋白,高温煮样容易导致蛋白聚集,强烈推荐在裂解后不煮沸样品,防止出现无信号现象。 


• 由于P-糖蛋白是多次跨膜蛋白,不同的裂解方式对蛋白的提取影响较大。推荐根据实验样本不同,对裂解方式进行优化。 


• P-糖蛋白在不同组织细胞中的表达不同,有些样本可能会出现弱表达或无表达的情况。请选择合适的实验样本,推荐使用阳性对照,以确认实验体系没有问题。



👉🏻SREBP1

WB实验注意事项

• SREBP1是一个多次跨膜蛋白,煮样可能导致蛋白聚集。如果煮样后检测不到信号,推荐提取蛋白时不煮样。 


• P-糖蛋白在不同组织细胞中的表达不同,有些样本可能会出现弱表达或无表达的情况。请选择合适的实验样本,推荐使用阳性对照,以确认实验体系没有问题。 


• 由于SREBP1会经历可变剪切,因此存在多种异构体,WB检测时有可能出现多条条带现象。


建议不要裁膜,或者保留40-250 kDa范围,防止蛋白信号丢失。




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睿捷生物是一家专注于生命科学领域的仪器、试剂、耗材供应商。公司代理 Abcam,Stemcell,Brand,Abmole,Agilent,SAB等10余家欧美著名生物技术公司的试剂仪器耗材。
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