今天小编分享一篇2021年9月发表在J Int Med Res的文章（IF:1.671），题目为“Integrative analysis of ferroptosis-related genes in ulcerative colitis”。
节
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背景与方法
背景：本研究的目的是鉴定和验证溃疡性结肠炎（UC）中铁死亡相关的标志物，以探索UC诊断和治疗的新方向。
方法：
1. 使用生物信息学方法分析UC组和正常对照之间的差异表达基因（DEGs）和与铁死亡相关的DEGs。
2. 蛋白质-蛋白质相互作用分析鉴定hub基因。
3. 外周血芯片和动物实验用于验证铁死亡相关的hub基因。
4. 构建了hub基因-转录因子、hub基因-microRNA（miRNA）和hub基因-药物相互作用网络。
结果
1.
结果：
1、UC 中与铁死亡相关的 DEG
差异表达基因（DEG）（图1）。(a) GSE75214的火山图。红点表示上调基因；绿点表示下调基因；黑点表示无统计学意义的基因。(b) 与铁死亡相关的 DEG 的维恩图。
图1
2、富集分析结果
铁死亡相关差异表达基因（DEGs）的富集分析（图2）。(a) 铁死亡相关 DEG 的细胞成分分析。(b) 与铁死亡相关的 DEG 的分子功能分析。(c) 与铁死亡相关的 DEG 的生物过程分析。(d) 京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 途径分析铁死亡相关的 DEG。
图2
3、PPI 和hub基因分析
蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和铁死亡相关的hub基因（图3）。(a) 使用 GeneMANIA 构建的 PPI 网络。(b) 前十个hub基因。
图3
4、外周血和动物实验中hub基因的验证
在外周血和动物实验中验证hub基因（图4）。(a) CD44在外周血中的表达( P < 0.05)。(b) MUC1在外周血中的表达( P < 0.05)。(c) BALB/c 小鼠结肠组织中 CD44 的表达（免疫组织化学，×400）。
图4
5、miRNA、TF 或靶向hub基因的药物的预测结果
microRNA (miRNA)、转录因子 (TF) 或靶向hub基因的药物的预测网络（图5）。(a) 靶基因-miRNA 网络。(b) 靶基因-TF 网络。红色圆圈节点代表中心基因，黄色方块代表 miRNA 或 TF。(c) 药物-CD44 相互作用网络。(d) 药物-MUC1 相互作用网络。红色圆圈节点是hub基因，黄色菱形节点是预测的药物或分子化合物。
图5
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