今天小编和大家分享一篇23年2月发表在Am J Transl Res杂志（IF:3.9）的文章《TREM2 as an independent predictor of poor prognosis promotes the migration via the PI3K/AKT axis in prostate cancer 》。在这篇文章中，作者利用公共数据库数据和生信分析的手段探讨了 TREM2 在 PRAD 中的预后价值。
背景
TREM2基因在多种恶性肿瘤中表达上调，前列腺腺癌（ PRAD ）是最常见的癌症之一，具有很高的发病率和死亡率。尽管越来越多的证据表明 TREM2 与各种肿瘤之间存在关联，但在PRAD 中调节 TREM2 的潜在机制仍不清楚。
方法
1.GTEx和TCGA数据库下载PCa 和正常组织测序信息；
2.使用 Oncomine 数据库、Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库和人类蛋白质图谱 (HPA) 数据库评估了 TREM2 表达。
3.TREM2 与PRAD患者临床特征分析
4.单因素和多因素cox进行独立预后分析。使用 Kaplan-Meier (KM) 方法分析了 TREM2 差异表达与PRAD 预后的关系。
5.列线图构建
6.从 TCGA 中提取与 TREM2 相关的差异表达基因 (DEG)进行富集分析及PPI网络构建
7.TREM2相关信号通路富集分析
8.PRAD患者TREM2表达与TME的相关性分析
9.免疫因子相关分析
10.实验验证
结果
1.TREM2泛癌分析结果显示，他几乎在所有癌症表达上调，且多个数据库信息中显示在PRAD 中表达显著上调。这些结果表明 TREM2 可能促进前列腺癌发生。
2.PRAD患者TREM2上调与不良临床病理特征的关系分析显示TREM2 表达的增加可能与 PRAD 中较差的临床病理学特征和更易危有关。
3.探讨 TREM2 是否作为 PRAD 患者预后的独立因素显示TREM2上调是PRAD患者PFI预后的独立标志物。基于独立预后分析构建的列线图模型有较高的预测能力。
4.根据 TCGA 数据库 TREM2 mRNA 表达的中位数将PRAD 样本分为高表达组和低表达组，以有效评估 TREM2 相关 DEG 的生物学功能。共表达基因与白细胞增殖、单核细胞和淋巴细胞的调节相关。PPI网络也进行了有较关键30个基因。
5.TREM2相关信号通路富集分析在具有高 TREM2 表达的组中观察到 PI3 K/Akt 轴和癌症通路的显着富集。
6.TME相关分析显示，TREM2水平与肿瘤纯度呈负相关，与多种免疫细胞浸润呈现正相关，PRAD 患者的 TREM2 上调与 CD8 + T、NK 的显着更高浸润水平相关。多种肿瘤细胞相关趋化因子受体和趋化因子与 TREM2 表达之间存在显着关联。
7.在 TCGA 的 PRAD 样本中，TREM2 表达与估计分数（ r = 0.590）、免疫分数（r = 0.540）和基质分数（r = 0.530）密切相关。TREM2 与程序性死亡 1 (PD-1) ( r = 0.280)、程序性细胞死亡配体 1 (PD-L1) ( r = 0.260) 和细胞毒性 T水平呈正相关淋巴细胞相关蛋白 4 (CTLA4) 。
8.随后，使用 TISIDB 数据库分析了泛癌中免疫调节剂的存在与 TREM2 水平之间的关联（图 8A).图 8B-G显示 TREM2 与 PRAD 中的六种免疫调节剂之间的相关性最高。
9.实验部分设计了免疫组化等就不进行展示，很感兴趣的老师可以搜索原文阅读
