早上好呀，今天要给大家介绍一篇2021年发表在Front Cardiovasc Med杂志上的文献，题目为《Regulatory T Cell-Related Gene Biomarkers in the Deterioration of Atherosclerosis》IF:6.05。
动脉粥样硬化恶化中的调节性 T 细胞相关基因生物标志物
摘要：
背景：调节性T细胞(Tregs)已被证明对动脉粥样硬化的发展具有保护作用，动脉粥样硬化是心血管事件的主要病理原因。在此，旨在探讨Tregs相关基因在动脉粥样硬化恶化中的作用。
方法和结果：从GEO数据库中下载了 29 个动脉粥样硬化样本的基因表达谱，登录号为GSE28829。CIBERSORT 算法估计的 Tregs 丰度与动脉粥样硬化分期呈负相关。利用limma检验和相关性分析，早期和晚期动脉粥样硬化斑块之间总共159个差异表达的Tregs相关基因（DETregRGs）。使用 DAVID 工具进行的功能注释分析表明，DETregRGs 主要富含炎症反应、免疫相关机制以及补体和凝血级联、血小板活化、白细胞跨内皮迁移、血管平滑肌收缩等途径。然后构建了 DETregRGs 的蛋白质-蛋白质相互作用网络，网络中连通度≥20的节点被选为hub DETregRGs。这些hub DETregRGs 的表达模式在几个独立的数据集中得到进一步验证。最后，使用单一样本评分方法为五个 DETregRGs 建立基因特征，可以区分心肌梗死患者和稳定型冠心病患者。
结论：本研究的结果将提高我们对动脉粥样硬化进展中 Tregs 相关分子机制的理解，并有助于发现急性心血管事件的新生物标志物。
结果：
1、动脉粥样硬化进展中的 DETregRGs
在晚期和早期动脉粥样硬化斑块中鉴定 DETregRG如图1。(A) CIBERSORT 算法估计的 27 个样本中 22 个免疫细胞的丰度。(B) 13个早期斑块样本和 16 个晚期斑块样本之间的 Treg 分数。(C) 13个早期斑块样本和 16个晚期斑块样本之间差异表达基因的火山图。
图 1
2、DETregRGs 的功能富集
DETregRGs列表已上传到 DAVID 6.8 网页进行功能分析（表1）。这些基因主要参与 GO 生物学过程，如炎症反应、脂多糖介导的信号传导、细胞表面受体信号传导等。此外，KEGG通路富集分析表明，与DETregRGs相关的信号通路包括补体和凝血级联、血小板活化、趋化因子信号通路、白细胞跨内皮迁移和血管平滑肌收缩。
表1
3、PPI网络分析
使用STRING数据库构建的DETregRGs的PPI网络（图2）。
图2
4、Hub DETregRGs 在动脉粥样硬化病变中的验证
晚期和早期动脉粥样硬化斑块之间hub DETregRGs 的表达模式（图3）。(A) GSE28829数据集中五个hub DETregRG 的无监督层次聚类热图。(B)验证稳定和不稳定动脉粥样硬化斑块之间的hub DETregRG。(C)验证有和没有 IPH 的动脉粥样硬化之间的hub DETregRG。
图3
5、Hub 基因特征的临床意义
TregRG 评分对 MI 患者的诊断性能（图4）。（A、B）分别在GSE59867和GSE62646数据集中的sCAD和MI 患者之间的 TregRG 评分。（C，D）分别用于GSE59867和GSE62646数据集中诊断 MI 的 TregRG 评分的ROC曲线。
图4
结论
总之，这项研究提供了可能与动脉粥样硬化疾病阶段相关的 Tregs 相关基因的综合观点。我们已经确定了几种可能将 Tregs 与动脉粥样硬化恶化联系起来的分子机制。此外，有五个基因被认为在动脉粥样硬化斑块演变和不稳定中起关键作用。这些结果可能有助于我们更好地理解与 Tregs 在动脉粥样硬化恶化中相关的功能机制，并为急性心血管发作的诊断或治疗提供候选生物标志物。
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