今天小编分享一篇2020年5月发表在Front Neurosci的文章（IF :4.677），题目为“Identification of the Hub Genes Related to Nerve Injury-Induced Neuropathic Pain”。
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背景与方法
背景：神经系统中疼痛敏感神经元的反应性增强是神经性疼痛 (NP) 发病机制的一个特征，但其潜在机制需要充分了解。在本研究中，我们试图阐明与NP相关的中枢基因和信号通路，以为NP提供有效的诊断和治疗方法。
方法：
1.从 GEO 数据库下载微阵列表达谱GSE30691。
2.使用差异分析筛选与 NP 发育相关的基因。
3.进行GO注释和KEGG通路分析以探索基因被激活的生物学功能和信号通路。
4.进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析和GO分析，以进一步鉴定与NP发育密切相关的hub基因。
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结果
1. NP相关基因的鉴定
NP相关基因的鉴定（图1）。(A) SNI 组与 Sham 组分别在术后 3、7 和 21 天的火山图；(B)维恩图显示了来自 3 个时间段的常见 NP 相关基因。
图1
2. GO 和 KEGG 分析 NP 相关基因
GO和KEGG分析NP相关基因（图2）。(A) 94 个 NP 相关基因中最丰富的 GO 术语；(B) 94 个 NP 相关基因中最活跃的 KEGG 通路。
图2
3. PPI网络分析与Hub基因鉴定
PPI网络分析和枢纽基因的鉴定（图3）。(A) PPI网络中涉及最高分的功能模块的48个基因；(B) : 48 个基因中最丰富的 GO 术语；C：48 个基因的富集 GO 项的比例图。
图3
与 NP 相关的 Hub 基因以及 SNI 和 Sham 大鼠不同时间段内每个 hub 基因的相对表达（图4）。(A) PPI网络中hub基因的节点数；(B) Sham 和 SNI 大鼠不同时间段内每个 hub 基因的度数高于 10 的相对表达量。
图4
结论：
总之，我们通过多种生物信息学方法发现了94个NP相关基因和相应的丰富的生物学功能和信号通路。此外，还鉴定了 8 个与 NP 发育调控有关的hub基因。我们的研究结果为未来探索 NP 发展的分子机制奠定了基础，并有助于寻找 NP 诊断和治疗的潜在靶点。
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