早！今天小编和大家分享一篇2021年4月发表在Am J Transl Res杂志（IF：4.06）的文章《Identification of key gene modules and pathways of human platelet transcriptome in acute myocardial infarction patients through co-expression network》，作者通过运用WGCNA，分别鉴定了ST段抬高型心肌梗死（STEMI）和非ST段抬高型心肌梗死（NSTEMI）中血小板相关的中枢基因。全文没有什么复杂分析点，却发到了4+，下面我们就来看看吧！
背景&方法
急性心肌梗死（AMI）的特征性病理变化是急性心肌缺血和坏死，根据心电图特点，AMI可分为ST段抬高型心肌梗死（STEMI）和非ST段抬高型心肌梗死（NSTEMI）两种。研究发现，血小板活化发生在血栓形成过程中，并在心血管疾病和事件中发挥作用。识别两种 AMI 临床亚型的转录本将有助于识别与 STEMI 和 NSTEMI 相关的途径，并为 NSTEMI 和 STEMI 患者开发专门定制的疗法。
研究方法：
1.RNA 序列数据和患者临床特征获自GSE65705。该数据集由 16 名 STEMI 患者和 16 名 NSTEMI 患者的动脉血中的 32 个血小板转录组样本组成。
2.分别构建STEMI和NSTEMI的WGCNA基因共表达模块，与临床信息相结合，筛选关键模块基因。
3.共表达模块的功能富集分析：对模块基因进行GO和KEGG富集分析，并筛选hub基因。
研究结果
STEMI和NSTEMI共表达模块的构建
使用 WGCNA 软件包工具构建 STEMI 和 NSTEMI 样本的基因共表达网络。STEMI建立了7个基因共表达模块，NSTEMI建立了10个基因共表达模块，根据样本临床特征，选择了与心肌梗死相关的危险因素数据，包括性别、年龄、体重指数（BMI）、高血压（HT）、血脂异常和冠状动脉疾病（CAD），在STEMI中，skyblue模块中的基因与BMI的临床特征显著相关。在NSTEMI中，skyblue模块中的基因与CAD的临床特征显著相关，cyan模块中的基因与HT临床特征显著相关，salmon模块中的基因与HT临床性状显著相关。
共表达模块的功能富集分析
对 STEMI和 NSTEMI中与临床特征显著相关的模块的基因进行 GO 富集分析和 KEGG 分析。
Hub基因的鉴定
通过 Cytoscape 软件使用 Cytohubba 包分析模块和hub基因的连接性，筛选STEMI 和 NSTEMI关键模块中的hub基因。
中科生信
/ 为您提供“一站式”科研定制服务