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5+:DNA损伤结合免疫治疗

5+:DNA损伤结合免疫治疗 中科生信
2022-05-22
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导读:早!今天小编和大家分享一篇2021年11月发表在Aging杂志(IF:5.682)的文章《Mutations

早!今天小编和大家分享一篇2021年11月发表在Aging杂志(IF:5.682)的文章《Mutations in DNA damage response pathways as a potential biomarker for immune checkpoint blockade efficacy: evidence from a seven-cancer immunotherapy cohort》,作者围绕DNA损伤反应探究了7种癌症中DNA损伤与免疫治疗预后的关联。这个文章也提供了一个很好的肿瘤研究方向。下面就跟随小编一起来看看吧!

背景&方法

背景

研究证明DNA 损伤反应 (DDR) 通路突变对免疫检查点阻断 (ICB) 治疗的影响。主要存在六种 DNA 损伤反应 (DDR) 信号(即错配修复 [MMR]、核苷酸切除修复 [NER]、同源重组 [HR]、范可尼贫血 [FA]、检查点和特定 DDR 基因)来执行功能基因组维护,从而保持基因组完整性。最近的另一项研究表明,DDR 信号的共同突变与突变负荷升高、免疫特征富集增加、客观反应率提高和 ICB 存活时间延长显著相关。

方法

1.对患者的DDR相关基因突变情况进行分析;

2.分析在ICB治疗中DDR突变患者与没有DDR突变患者的预后差异;

3.在七种癌症中,分别评价有无ICB治疗组中,DDR突变对预后的影响;

4.结合不同临床信息,探究DDR突变对预后的影响;

5.分析单个DDR基因的生存曲线;

6.有无DDR突变的情况下,分析免疫浸润细胞、免疫检查点和免疫特征的差异。

研究结果

纳入患者的临床特征和DDR突变

在 1363 名 ICB 治疗的肿瘤患者中,115 名(8.4%)患有 BG,211 名(15.5%)患有 BLCA,109 名(8.0%)患有 CRC,129 名(9.5%)患有 HNSC,344 名(25.2%)患有 NSCLC,142 名( 10.4%) 患有RCC,313 (23.0%) 患有SKCM。493 例 (36.2%) 肿瘤在至少一个 DDR 基因中存在突变,870 例 (63.8%) 肿瘤为 DDR 野生型亚组。

DDR 突变与 ICB 治疗和 ICB 治疗初治患者预后的关联

在包含 ICB 治疗患者的 MSKCC 队列中,生存分析显示 DDR 突变患者的总生存期 (OS) 明显优于没有 DDR 突变的患者,单变量和多变量cox分析同样得到相同的结论。在 TCGA 队列中,结果与MSKCC一致,这些结果表明 DDR 突变在预测免疫治疗环境中的预后方面具有更积极的作用。

DDR突变与7种不同癌症的预后相关

使用 MSKCC 和 TCGA 队列评估了 DDR 突变在 7 种不同癌症亚型中的预后能力。仅当生存曲线具有统计学意义时,才执行调整了混杂因素的多变量 Cox 模型。在ICB治疗下,DDR 突变对 BLCA 和 CRC 患者免疫治疗效果的潜在预测意义。而在非 ICB 治疗的 TCGA 队列中,DDR 突变的 SKCM 患者的生存结果明显优于野生型患者。

DDR突变与不同临床条件下的预后

我们使用 MSKCC 和 TCGA 数据对不同亚群中的 DDR 突变进行了分层分析和多变量 Cox 回归模型。

单个DDR基因突变与预后

为了了解每个 DDR 基因对免疫治疗效果和预后的影响,我们在 2 个队列中评估了单个 DDR 基因突变与患者生存率的关联(此处只展示两个基因)。

与DDR突变有关的微环境因素

我们探索了微环境因素与 DDR 突变之间的相关性,以解释为什么 DDR 突变的患者具有更好的免疫治疗预后。检验指标包括22种免疫细胞,33个免疫检查点和15个免疫相关特征。


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