AAV表征新方法——冷冻电镜
腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)是目前发现结构最简单的、无包膜的单链DNA病毒。由蛋白衣壳(capside)和长度为4.7kb的单链DNA基因组构成,衣壳长度为20 ~ 25nm,属于细小病毒家族。AAV基因组两端为末端反向重复序列(inverted terminal repeat, ITR),是病毒DNA复制的起点和触发病毒包装的信号。由于其较低的免疫原性和位点特异性整合能力,被认为具有较好的安全性,是基因治疗领域最重要的基因载体之一。
电镜是科学研究中进行原子和分子尺度表征的重要工具。冷冻电镜是电子显微镜的衍生技术,在冷冻电镜的成像过程中,生物样本被封装在薄层玻璃态冰中,在电子束辐照下,仍处于原始结构和本征状态。
随着对AAV药物临床的不断推进和早期研究的进一步深入,AAV衣壳表征对理解基因疗法的药效和安全性显得愈发重要,也愈发成为药物申报过程中的必要研究项目。
在AAV载体生产过程中,最具有挑战的任务是去除掉有缺陷的AAV载体,即去除空的衣壳病毒颗粒或者含有全长基因以外DNA的病毒载体颗粒。填充衣壳和空衣壳的比例是必不可少的质量控制条件。
冷冻电镜可以清晰地看到AAV的内部情况,区分填充衣壳、中间状态和空衣壳。除此之外,AAV产品的团簇状态、完整性等形态信息也都可以使用冷冻电镜检测出来。
更值得一提的是,冷冻电镜还可以解析出AAV的衣壳结构,这对于理解AAV病毒感染细胞的分子机制和改造AAV载体具有非常重要的意义。
相比于其他的表征技术手段,冷冻电镜可以做到直接、可视化的对样品进行观察,使表征数据更具有说服力;同时,一次表征多种指标,减少了对AAV样品的消耗,降低了表征检测的成本。
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