公司如果要进行股权转让，需要缴纳哪些税？如何进行合法的股权转让税收规划？
1、增值税
个人股东转让上市公司股权，可以免征增值税！企业转让上市公司股权，需要按照金融商品转让缴纳相应的增值税。
也就是说，作为金融商品转让的税率，一般纳税人为6%，小规模纳税人为3%。
2、企业所得税
企业所得税，顾名思义，是企业缴纳的。但是印花税不一样，双方都交，所得税是转让方交！
公司转让股权时，应当按照转让财产的所得税项目缴纳企业所得税。但是，企业实际发生的合理费用，如成本、费用、税金、损失等。与收入有关，在计算应纳税所得额时可以扣除。
3、个人所得税
根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，自然人股东的股权转让所得，应按照“财产转让所得”项目征收个人所得税。
财产转让所得为应纳税所得额，是指个人每次转让财产取得的所得，减除财产原值和合理费用后的余额，适用20%的比例税率。
个人转让上市公司股份暂免征收个人所得税。但对个人转让限售股所得，根据“财产转让所得”，按20%的比例税率征收个人所得税。
4、印花税
股权转让需要签订股权转让合同或协议，而法律法规规定交易合同需要缴纳印花税。
提醒：被投资企业不用缴纳印花税，没有代扣代缴义务，股权受让方自行办理。
非上市公司股份转让，应当根据《产权转让证书》进行评估，证书持有人按照载明金额的万分之五申请贴花。
和个税一样，如果企业股权转让价格明显偏低，税务机关有权核定，要按照税务机关核定的价格缴纳印花税。
5、土地增值税
如果在股权转让过程中，房地产价值占公司净资产的比例较大，税务机关可以认定股权转让的实质是房地产的转让，征收土地增值税。
在股权转让中，以下问题需要注意：
1、区分转让股份的是个人还是法人
非上市公司在进行股权转让时会涉及到的主要是所得税，但由于主体不明确，所以要分对象，分清转让股份的股东是个人还是法人，看个人所得税还是企业所得税。
2、一般情况VS特殊情况，实际＞形式
例如，一些企业以买卖股权的名义进行住宅买卖，那么土地增值税也被征收。
因此，进行股权转让操作要注重实质原则。如果通过直接转移全部所有权，来达到房地产买卖的目的，依旧可能被征税。
3、注意出资问题，避免瑕疵
公司章程约定股东出资期限的，股权转让应当注意承担的责任。受让人股东转让方出资不足的，要看公司章程约定的出资期限。
出资期限届满，老股东未出资的，应当要求老股东全额缴纳出资后再转让。尚未到约定的出资期限的，与原股东协商，确定该部分出资义务由谁完成，并在股权转让协议中明确约定。
1、正当理由低价转让个人股权
何为“正当理由”，国家税务总局公告2014年第67号给出的四个情形，典型的如：
相关法律、政府文件或企业章程规定，并有相关资料充分证明转让价格合理且真实的本企业员工持有的、不能对外转让股权的内部转让。
股权低价转让，本质上是为了让交易价值更加符合实际，需要注意的是，该种情形适合特定的企业，同时提交的材料应符合实际。
2、恰当运用“核定”法
67号文第十七条规定：“个人转让股权未提供完整、准确的股权原值凭证，不能正确计算股权原值的，由主管税务机关核定其股权原值。”
但是，对于核定方法，没有给出具体的规定，实际上是把权限给了各地税务机关。
从之前的各地实践来看，比如，陕西省税务机关会结合验资报告、银行询证函、银行存款日记账、实收资本(股本)账面记录、公司章程、等进行审核对比以核定原值，海南省按申报的股权转让收入的一定比例（15%）核定计税成本。
3、变更被转让公司注册地，争取税收优惠或补贴
为了招商引资，发展地区经济，国家及地方层面都出台了一系列的区域性税收优惠政策，多数经济开发区都出台了财政返还政策。
各地出台的区域性的税收优惠政策或财政返还政策，实际上是降低了实际的税负率。
4、通盘考虑企业所得税和个税
对于间接持股的股东，应该通盘考虑企业所得税和个税，而不是就个税论个税，可以积极争取行业性、区域性优惠政策，降低企业所得税税负，实现个人整体税负的降低。
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