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吸附建模中“隐秘的角落”

吸附建模中“隐秘的角落” 高通量材料计算
2021-04-24
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导读:吸附 | “10分钟学会吸附基底的收敛性测试”

 心中有“数”,快人一步

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dsorption

教你又快又好地学会理论计算

◆ ◆ ◆ ◆


上一篇文章我们详细阐述了吸附基底建模需要注意的相关问题,忘记了内容的童鞋点击下方传送门回顾文章,本文我们来学习如何进行表面能收敛性,从而确定基底和真空层厚度。


吸附基底建模


◆ ◆ ◆ ◆

目录

◆ ◆ ◆ ◆

一、表面能计算公式

二、建模及计算注意事项

三、Cu(111)面基底和真空层厚度的收敛性测试

1表面能


什么是表面能


表面能是恒温、恒压、恒组成情况下,可逆地增加物系表面积须对物质所做的非体积功。


     

简单来说就是表面产生后,由于表面原子存在不饱和键(也叫作悬挂键),使得表面比体内具有更高的势能,称为表面能。

 

表面能可以作为测试slab模型在不同基底或真空层厚度时的稳定性判据,逐渐增加slab厚度或Thickness of Vacuum后,当表面能误差趋近于0.001 eV,即可视为模型合理。


表面能的不同计算公式

 

1、固定slab模型底层原子,仅弛豫上表面两到三层原子

公式来源DOI: 10.1039/C7NR03889E



在同一计算级别下得到如下信息


slab模型优化后的能量(左)

slab模型单点能(中)

bulk模型优化后的能量(右上)

表面能公式如下:



其中,A为表面面积(右下),n的取值需要使n*bulk模型的总原子数等于slab模型。


2、弛豫所有原子或仅弛豫上下表面的原子

公式来源DOI: 10.3390/nano10030484



在同一计算级别下得到如下信息


slab模型优化后的能量(左)

bulk模型优化后的能量(右上)

表面能公式如下:


其中,A为表面面积(右下),n的取值需要使n*bulk模型的总原子数等于slab模型。


本文采用此方式进行测试。



2注意事项


建模注意事项


对于不同基底层数的收敛性测试,需要保证真空层方向的晶胞长度(注:不是真空层)一致,否则表面能会随着基底厚度的增加而增加,导致无法收敛;


②真空层测试仅需要保持基底层数不变即可。



计算注意事项


slab模型结构优化过程中,要保证晶胞形状和体积不变(ISIF=2)


②采用单胞进行测试即可。


3实战演练


本例中对Cu (111)面不同基底和真空层厚度进行了收敛性测试。

DOI: 10.1103/PhysRevB.87.245402



下表中基底层数为Cu原子层的层数;

原子数代表slab模型总原子数;

优化能量为slab模型的总能量;

为了与文献保持一致,A表示一个表面的原子数;

Difference为当前结构与上一结构表面能差。




结合图表信息可以发现,当Cu (111)基底原子层层数为7时,表面能收敛至0.001 eV/atom。同理,真空层厚度选择6.3 Å即可(注:因为吸附建模时需要在基底上放吸附物,所以此处真空层厚度的选择需要加上吸附物的高度)。

 

最后,特别感谢水有魚兮等网友的认可,你们的肯定就是我们努力的方向!!!











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