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用传统材料计算方法真的要淘汰了!原来计算可以这么快?!
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用传统材料计算方法真的要淘汰了!原来计算可以这么快?!
高通量材料计算
2021-09-15
2
导读:警告!再不弃掉传统材料计算方法你就被落下了!
我们整理了开始计算前需要做的准备:
由图可见
,在正式开始计算前要
购置
服务
器、服务器定期维护、熟练掌握Linux操作系统、安装软件、学习计算模拟理论知识、掌握各种后处理软件
、
至少需要半年的准备
时间
,
然而后期对服务器的维护也需要耗费一定的精力
。时间宝贵,如何将有限的时间运用到做计算中成为提高科研效率的关键,其中理论知识的学习是必不可少的,因此我们可以从其余
三个方面来进行
“加速”
。
我们以石墨烯吸附COOH分子为例展示平台是如何进行计算并得到体系的能带和态密度。
(1)首先是上传结构。
MatCloud+支持多种格式文件的上传,如果您需要使用VASP进行计算,直接上传
cif
格式也是可以的,平台会自动将其转变为POSCAR文件。
(2) 然后是建模。
MatCloud+的建模功能可以轻松的实现扩胞、切面、随机取代、建立吸附构型等操作。对于本例中的石墨烯吸附构型我们可是使用【扩胞】以及【吸附建模】来完成。
首先对石墨烯结构进行扩胞来控制吸附浓度,创建工作流,将左侧【通用导入组件】推拽到右侧工作流搭建页面,然后在建模中的【超晶胞(扩展原始晶胞)】拖拽到右侧,点击参数设置晶胞扩展的倍数,设置成功后保存提交任务,
此过程不需要超算核实,很快便可完成;
然后将扩胞完成的结构导出到结构集,创建新的工作流,将左侧【通用导入组件】推拽到右侧工作流搭建页面,然后在建模中的【吸附建模(分子)】拖拽到右侧,在设置中进行简单的参数设置,保存之后提交任务便可得到一个石墨烯吸附COOH分子的结构。将结构导入结构集以备进行计算。
(3) 计算过程。不同于传统的计算,MatCloud+中的参数都可以通过点选的形式进行设置,
对于Linux的小白这是很友好的。
首先是搭建工作流,在这里我们添加【并行控制器】和【分支控制器】,这样就可以同时进行能带以及态密度的计算了。设置各个组件的参数,之后保存提交任务。
(4) 在计算完成后我们点击【能带结构】组件的【查看结果】就得到了如下的
页面。不同于传统计算需要对能带结果进行复杂的后处理,能带图直接展示在页面中,并且费米能级与带隙的大小也以数值形式展示在页面上。同样的态密度的结果也不需要进行后处理,MatCloud+还支持PDOS的绘制。
如上的一系列操作之后我们的计算就结束了,总共耗时约20分钟。相同的内容我们以传统方式进行处理、计算需要消耗的时间也列在下表中。
可以发现在传统的计算中中间的操作过程耗费了更多的时间,而这正是MatCloud+可以帮助您的地方——解放您的双手,不需要进行重复的敲击键盘,众多操作只需要用鼠标点一点便可实现,为您的计算过程进行“加速”,轻松实现高通量计算!
它将计算模拟软件、计算集群、数据库、和模拟仿真
一体化置于云端,用户仅需一个网页浏览器(只要有网络便可以提交计算任务),通过鼠标的点击便可开展高通量材料计算和筛选、数据管理、以及数据挖掘等。
MatCloud+材料云提供了集成的建模
工具
、工作流模板、数据库、可视化展示、和云存储,实现了材料计算作业的在线提交和监控、结果分析,数据提取和数据存储的自动化流程实现。
这为您大大减少了服务器制备、软件安装、后处理的时间。
多个渠道多个方法,不如扫码进群免费试用,
还有500机时等着你,行动起来!
【声明】内容源于网络
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高通量材料计算
普及材料基因工程高通量材料集成计算理念,推广通过高通量材料计算和人工智能,进行材料的成分设计,性质预测及机理解释等方法和技术。
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