我们2026年第一期的马拉松直播互动授课已经结束了，如果你想看前面的，也可以关注这个专辑哈！马拉松授课互动答疑，里面包含了我们整理的每一期超详细的答疑。
以往我都会放这个超详细内容出来给大家看，可能看的仔细的人会很少吧，现在有了AI，让AI看看生信初学者都有哪些问题呢？你是不是正好也都遇到了这些问题？来看看~ 太长不看版直接翻到文末看总结！
这期的答疑互动也是彩蛋多多，现在整理完毕马不停蹄的分享给大家。2026年3月的直播互动授课，有需要的朋友还可以上车：
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生信入门&数据挖掘线上直播课2026年3月班，你的生物信息学入门课
前排提醒，下面是一个答疑示例。
【问题标签】这里是问题
这里是问题补充。
“这里是解答。
【Rstudio】请问要更新它吗
“都可以。
【Rtools安装】安装r包时为什么会这样呢
“微信群公告网盘里有一个软件，Rtools，注意版本是45的，先安装一下，要安装在C盘默认路径，不要修改它，安装好了再重新运行这句代码：
BiocManager::install('S4Vectors', type='source')
【R包安装】这样之后就可以了么
“你前面一句代码，需要回答一个
n。
【R包安装】不知道为啥报错
“把提示不存在的R包重装一下，前面有代码。
【R包安装】这个提示是什么意思呢
“提示信息说这个R包已经安装刚好了，不用重复安装。接下来把library的代码都运行一次，看看是否还有某些包没安装成功。
【R包安装】安装R包的时候报了这个错
“从第一行代码开始顺序运行哈，先安装R包再加载。
【Rtools】这算Rtools安装好了吗？运行哪个，再去R
“安装好就行，不用运行，可以检查一下应用里面是否可以看到有Rtools。
【R包安装】这个是运行好了吗？有个警告
“运行好了，没有报错。
【文件锁定】我今天更新了R版本后，重新安装R包，出现了这个问题，应该怎么解决呢。删除锁定文件吗？
“进去这个目录手动删除，或者，重启电脑即可。
【样本处理】麻烦问一下，这是是不是需要删除异常样本？
“你这个不需要，中位数的纵坐标很小，你要是觉得不顺眼你就normalize。
【Termius设置】前几天注册的Terminus的free trial过期了，还能用吗？
“可以的，我们只需要免费的功能，任何收费功能都用不上。放心大胆用就好了~
【Termius设置】Termius设置中自动补全选第一个还是第二个，现在变成选项了
“建议是关闭哈。
【软件安装】之前在电脑上下载个linux，不影响咱这个上课吧
“不影响的, 我们是连接服务器, 只要termius能正常使用就可以了。
【环境管理】下载的参考基因组因为quota受限不能解压，然后根据AI提示删除了miniconda3。我现在就没有conda小环境了，之后还需要吗？
“conda小环境删了，没有处理的软件了，那么你下了这个参考基因组之后准备怎么处理呢？
【进程查询】我这个正常吗？我在ps fx没有找到 nohup中对应的ID
“你运行这个之前他就运行完啦。
【R包安装】我有几个包装不上
“你这个是linux，可能包写的有什么问题跟linux系统不太兼容，你试试装github版本。
【数据库连接】这是网络不行吗
“ena数据库偶尔连接不稳定，换个时间试试。
【Linux基础】登录进来后ls为什么不行了呢
“哪里“不行”了呢？不是正常地把文件夹里的内容列出来了吗？
【Conda安装】下载conda失败了，bash出了一点问题
“安装完要
source ~/.bashrc。
【分析实战】请问用下载Biocmanager下载SingleR的时候遇到这样的报错下载失败应该如何解决呢
“你的服务器缺编译工具。具体的可以让ai教一下，不一定能行，有的编译工具需要管理员权限。
【分析实战】加载SingleR中其他的参考数据库比如MouseRNAseqData，没有报错但R环境中没有出现相关数据呢？
请问老师还有其他办法可以下载参考库吗
“或许这个代码的作者把函数的名字和变量的名字给改掉了，你要仔细检查之前的代码。
此外，你还可以这么加载
lname <- load('MouseRNAseqData.Rdata')这样lname里面就是Rdata里面存在的变量，就知道是什么了.很适合当前R环境里面有很多变量，load一个进来不知道跑哪里去了的情况。
一、R语言与R包安装相关问题
几乎全是跟R包安装相关的答疑，那么R包安装是不是你的生信入门拦路虎？
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|---|---|---|
| Rstudio |
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| Rtools安装 |
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BiocManager::install('S4Vectors', type='source')
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| R包安装 |
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n
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| R包安装 |
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| R包安装 |
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| R包安装 |
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| Rtools |
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| R包安装 |
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| 文件锁定 |
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| R包安装 |
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二、服务器与Linux系统问题
也是很大篇幅的服务器登录，软件安装，提交任务管理
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|---|---|---|
| Termius设置 |
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| Termius设置 |
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| 软件安装 |
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| 环境管理 |
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| 进程查询 |
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| Linux基础 |
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| Conda安装 |
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source ~/.bashrc
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三、数据分析实战问题
也出现了包的报错等问题。
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|---|---|---|
| 样本处理 |
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| 数据库连接 |
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| 分析实战 |
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| 分析实战 |
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load('MouseRNAseqData.Rdata')查看lname中的变量
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不敢尝试：怕点错一下就把电脑弄坏了
不读提示：看到英文报错就跳过，不尝试理解
过度求助：遇到小问题第一反应是问人，不是自己搜
随意操作：不知道后果就删文件、改设置
缺乏耐心：下载安装等不及，网络不好就焦虑
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