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4.17-18日DNA及RNA甲基化数据分析、课题设计学习班(线上)

4.17-18日DNA及RNA甲基化数据分析、课题设计学习班(线上) 北京市计算中心有限公司
2021-03-26
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导读:课程介绍甲基化修饰,特别是DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和信使RNA(mRNA)中的N6-甲基腺苷(m6


课程介绍


甲基化修饰,特别是DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和信使RNAmRNA)中的N6-甲基腺苷(m6A)的甲基化,是由S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依赖性甲基转移酶产生。这些修饰在动植物的生命活动中发挥着重要的调节功能,并在多种肿瘤的发生发展中发挥着重要的作用。尤其是作为近年来研究热点的m6A,它是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学过程中扮演重要角色。

当前高分文章发表及国家自然基金支持情况均反映DNARNA甲基化尤其是m6A已成为当前学术研究的热点方向,是一个增长迅速、拥有巨大研究意义的新兴领域。鉴于DNA/RNA甲基化具有重要的临床研究意义,我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验的专家老师为大家详细的介绍DNA/RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培训使学员熟练的掌握甲基化相关课题的数据获得和分析过程,迅速成为表观遗传领域的主力军。

授课方式

1、理论结合实操;

2、案例讲解分析结合;

3、协助分析学员的实际数据

课程设置

2021年4月17-18日 线上 

上午8:30-11:30  下午13:30-17:00 晚上18:00-21:00

赠送视频供回放复习使用、线下免费复听 建群答疑

时间安排

课程主题

授课内容

方式

第一天

上午


DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路

1.明确DNA甲基化的作用机制及调控机理

2.了解DNA甲基化在疾病等各研究领域中的应用

3.了解DNA甲基化与转录组等多组学整合分析思路

4.通过高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读

5.掌握DNA甲基化研究的多种技术方法

6.了解常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库

理论

第1天

下午


DNA甲基化芯片及测序数据分析

1.DNA甲基化芯片及测序分析常用软件介绍

2.DNA甲基化芯片及测序数据分析策略

3.DNA甲基化芯片及测序分析图表解读

4.差异甲基化鉴定、注释及富集分析

5.DNA甲基化芯片数据分析 (ChAMP等软件)

6.DNA甲基化测序数据分析(bismark,methylKit等软件)

7.DNA甲基化与转录组数据整合分析

8.利用公共甲基化数据完成整套甲基化分析流程

实操

第一天

晚上


RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

1.RNA甲基化研究进展概述

2.了解RNA甲基化的概念和修饰类型

3.明确RNA甲基化对RNA加工代谢及生物学功能的调控机制

4.了解RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用

5.通过高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤等功能研究思路进行解析

6.了解RNA甲基化常用的各种测序技术

7.M6A甲基化的研究现状、思路和研究方法

理论

第二天

上午


M6A甲基化数据分析

1.了解各种RNA甲基化修饰谱分析技术

2.M6A测序技术流程介绍及测序报告解读

3.M6A常见分析内容及相关软件介绍

4.M6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析(R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等

5.M6A修饰基因的功能富集分析(DAVID,Metascape、GSEA等)

6.预测m6A甲基化位点在线工具介绍

7.M6A常用数据库介绍及使用(MeT-DB,m6AVar,RMBase)

实操

第二天

下午


M6A甲基化多组学整合分析,课题设计与基金申请

1.m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展

2.m6A甲基化与多组学数据(RNA-seq,Ribo-seq等)整合分析

3.非编码RNA(miRNA及lncRNA等)的m6A甲基化分析

4.通过TGGA、ICGC等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路

5.RNA甲基化研究策略与课题设计

6.RNA甲基化研究经验交流

7.RNA甲基化相关国自然课题的介绍

8.DNA及RNA甲基化基金申请思路、准备内容及方案设计注意事项等

9.讨论及个性化问题答疑

理论+实操


注册费用

3400元/人,可开会务费 注册费 检测费、分析服务费等发票。可以银行汇款、支付宝、微信、公务卡等

扫码报名


联系咨询

员老师010-59341773,18701529461(微信同号)

徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)

【声明】内容源于网络
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北京市计算中心有限公司
成立于1973年,国内最早的一批计算中心之一,致力于应用计算技术研究和服务。2010年,创建“工业云”服务平台,面向工业企业尤其是对制造型中小企业提供产品创新的公共服务平台。2011年,工业云成为北京市“祥云计划”十大重点示范工程项目之一。
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北京市计算中心有限公司 成立于1973年,国内最早的一批计算中心之一,致力于应用计算技术研究和服务。2010年,创建“工业云”服务平台,面向工业企业尤其是对制造型中小企业提供产品创新的公共服务平台。2011年,工业云成为北京市“祥云计划”十大重点示范工程项目之一。
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