近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从以前的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，举办“转录组学”专题实战班。欢迎报名参加。更多消息可关注“生信会议”公众号，会给您带来更多惊喜！
主办单位：北京市计算中心有限公司
协办单位：
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
参与方式：线上直播
课程安排：2022年4月12-14日（周二-周四） 上9:30-11:30 下13:30-17:00
日期 |
主题 |
内容 |
备注 |
第 一 天 |
转录组学前沿概述及测序原理 |
1.转录组技术发展前沿动态 2.转录组应用案例及应用热点 3.常用的转录组实验设计及测序建库技术 4.单细胞转录组测序技术 5.转录组技术流程及技术细节 |
理论 |
Linux服务器使用入门 |
1. 掌握Linux系统下的常用命令（重点讲解） 2. 掌握Linux环境下软件的安装使用 3. 了解Shell脚本的编写 |
上机操作 |
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第 二 天 |
转录组分析方法 |
1.差异表达基因的功能分析（重点讲解） |
理论 |
De novo转录组数据分析上机实践 |
1.原始测序数据的检测和预处理（重点讲解） 2.使用Trinity拼接转录组数据（重点讲解） 3.原始数据与拼接转录本的比对（重点讲解） 4.表达量统计和差异表达分析（重点讲解） 5.使用blast对转录本进行功能注释（重点讲解） 6.寻找转录本的ORF，翻译蛋白质序列 7.转录因子注释 |
上机操作 |
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Reference based转录组数据分析 上机实践（一） |
1.转录组数据准备和软件介绍 2.使用HISAT进行转录组数据的比对（重点讲解） 3.用IGV查看比对结果 4.使用cufflinks进行表达量估计和分析（重点讲解） 5.使用samtools检测转录组数据中的突变（重点讲解） |
上机操作 |
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第三天 |
Reference based转录组数据分析 |
1.lncRNA的定义、应用和发展 2.lncRNA的生物学过程 3.lncRNA研究的实验设计及测序原理 4.lncRNA测序分析结果解读 |
理论 |
Reference based转录组数据分析 上机实践（二） |
1.利用tophat和cufflinks组合，预测转录本 2.使用CNCI预测新的lncRNA转录本（重点讲解） 3.使用LncTar软件预测lncRNA调控的靶基因（重点讲解） |
理论+ 上机操作 |
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microRNA测序与数据分析 |
1.microRNA的定义、应用和发展 2.microRNA的生物学过程 3.microRNA研究的实验设计及测序原理 |
理论 |
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microRNA测序与数据分析（包含上机实践） |
1.microRNA测序数据分析软件（重点讲解） 2.microRNA测序数据预处理（重点讲解） 3.microRNA的预测（重点讲解） 4.microRNA靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解） |
理论+ 上机操作 |
注：内容以实际发生为准；若调，会提前通知。
【特惠活动】
注册费：4200元/人（含当期听课费、资料费、证书费、考试费（如有））。提供当期视频回放以供复习使用（羽林学院平台）。
开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。
本期班享受“报赠”特惠活动，即：注册费≥4000元的，即可获赠羽林学院视频课2个/人，＜4000元者，可获赠羽林学院视频课1个/人（皆可从文后所附视频课列表中选择）。
【惠上加惠】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额；
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡
单位全称：北京市计算中心有限公司
账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京中关村自贸试验区永丰基地支行
（汇款信息备注：“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称）
注：款项支出后，请提供付款回执给工作人员，方便核实到账、开具发票。
【扫码报名】
【咨询请联系】
QQ号：2814500767
邮箱：bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师 010-59341786，15801436028（微信同号）
员老师 010-59341773，18701529461（微信同号）
【注】开始前三天会发送邮件通知；若未接到邮件通知，请电话咨询。
附：活动选赠之羽林学院系列实战视频课，详情可登陆羽林学院-实战课查看
（羽林学院 https://applpzjnvwq4657.h5.xiaoeknow.com/homepage/10）
羽林学院视频课：计算机辅助药物设计——分子模拟与蛋白互作研讨班
羽林学院视频课：生命科学的数据可视化与科研作图——实用工具与技巧
羽林学院视频课：10×Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘培训班
近期"数字化人才培训"课程安排如下（课后提供视频回看供继续学习；）：
2022.03.09-11 生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班
2022.03.22-25 人工智能技术在医药健康领域中的应用
2022.03.28-30 计算机辅助药物设计（CADD）——蛋白质分子对接和网络互作研讨班
2022.04.07-08 知识图谱基础快速入门与案例应用实战班（本期推文）
2022.04.12-14 转录组学专题实操班（本期推文）
2022.04.18-22 实用生物信息学研讨班（本期推文）
2022.04.25-28 R语言数据分析与可视化高级研修班（本期推文）
【视频课：统计学系列课程】
敬请关注网站或微信公众号：生信会议
