作者：国浩律师事务所 陈媛媛
非营利性医疗机构与营利性医疗机构相比，享有更优惠的税收政策，但非营利性医疗机构的利润不能分配予举办人，仅能用于支付员工工资、医疗机构日常经营开支。对于希望获得更多利润回报、融资的非营利性医疗机构举办人而言，转变非营利性医疗机构性质为营利性是实现该目的的方式。其中，性质转变前后的税费区别值得关注。下文整理了非营利性医疗机构与营利性医疗机构的税费区别。
一、企业所得税
非营利性医疗机构：按照国家规定的价格提供医疗服务的收入免缴企业所得税，非按照国家规定的价格提供医疗服务的收入缴纳25%的企业所得税。其中，医疗服务指医疗服务机构对患者进行检查、诊断、治疗、康复和提供预防保健、接生、计划生育方面的服务，以及与这些服务有关的提供药品、医用材料器具、救护车、病房住宿和伙食的业务；提供非医疗服务的收入缴纳25%的企业所得税，但直接用于改善医疗卫生服务条件的部分，经税务部门审核批准可抵扣其应纳税所得额，就其余额征收企业所得税。其中，非医疗服务的收入指通过如租赁、财产转让、培训、对外投资等获得的收入。
营利性医疗机构：就其收入缴纳25%的企业所得税。
二、契税
非营利性医疗机构：承受土地、房屋直接用于办公、教学、医疗、科研的，免缴契税；非承受土地、房屋直接用于办公、教学、医疗、科研的，缴纳3%契税。
营利性医疗机构：缴纳3%契税。
三、房产税、城镇土地使用税
非营利性医疗机构：免缴房产税、城镇土地使用税。
营利性医疗机构：取得的收入，直接用于改善医疗卫生条件的，自其取得执业登记之日起，3年内免缴房产税、城镇土地使用税。
四、自产自用制剂的增值税
非营利性医疗机构：免缴自产自用制剂的增值税。
营利性医疗机构：取得的收入，直接用于改善医疗卫生条件的，自其取得执业登记之日起，3年内免缴自产自用制剂的增值税。
五、增值税（原营业税）
此外，鉴于增值税，即营改增前的营业税是医疗机构缴纳税收时非常关注的一点，所以虽然非营利性医疗机构与营利性医疗机构就此税种的税收政策相同，此处仍做一整理。
非营利性医疗机构与营利性医疗机构：就医疗服务免缴增值税。其中，医疗服务指不高于地（市）级以上价格主管部门会同同级卫生主管部门及其他相关部门制定的医疗服务指导价格（包括政府指导价和按照规定由供需双方协商确定的价格等）为就医者提供《全国医疗服务价格项目规范》所列的各项服务，以及医疗机构向社会提供卫生防疫、卫生检疫的服务；就非医疗服务缴纳6%增值税，但提供有形动产租赁服务缴纳17%增值税，提供交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权缴纳11%增值税，跨境服务免缴增值税。其中，非医疗服务指《全国医疗服务价格项目规范》所列的各项服务以外的服务。
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