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南京农业大学兽医学，其前身为1921年创立的东南大学畜牧兽医系，是我国成立最早的兽医学科之一。兽医学学科依托兽医学国家一级重点学科，涵盖预防兽医学、基础兽医学、临床兽医学三个国家二级重点学科。本学科拥有农业部动物细菌学重点实验室、农业部动物生理生化重点实验室、猪链球菌OIE参考实验室等研究基地。主办有创刊于1949年的专业学术期刊《畜牧与兽医》。学科自立项建设以来，在人才培养、学术研究等方面取得了重要进展，获得了良好的社会效益和经济效益。
学科建立了猪链球菌病诊断世界卫生组织（OIE）国际参考实验室1个，省部级科研平台4个；新增国家重大科研项目7项，发表SCI论文358篇，获国家科技进步二等奖1项，中国水产科学研究院科技进步一等奖1项，教育部科技进步二等奖2项，教育部技术发明奖二等奖1项，教育部自然科学奖二等奖1项；新增国家精品课程2门，发表专著15部；新增授权发明专利36项，新兽药证书4项，实现成果转化3项。
学科引进海外优秀人才9人，新增长江学者特聘教授1名，国家杰青1名，国家优青1名，江苏特聘教授1名，其他部省级人才20多人次。培养博士224名、硕士882名。1篇论文获全国优博论文提名，2篇论文获全国兽医专业学位优秀博士论文，3篇论文获江苏省优秀博士论文。获得国家级高等教育教学成果一等奖1项，江苏省高等教育教学成果一等奖2项，建立国家级动物科学类实验教学中心1个，培养研究生1259人，建立兽医专业学位研究生教育人才培养新模式1个。
本学科教师先后有近100人次到国外进修、攻读博士学位、合作科研。与美国、加拿大、丹麦、澳大利亚、英国、日本、西班牙等国和我国台湾地区的有关学校、研究机构建立了合作关系，与德国汉诺威兽医学院建立了校际关系。2013年起与加州大学戴维斯分校兽医学院在中国南京联合开办了国际高端兽医继续教育课程。此外，本学科每年吸纳大量留学生前来学习深造，先后举办了近20期国际兽医针灸与中药培训班。
