《深海越狱》讲述的是中情局卧底特工斯科特·维勒(尚格·云顿饰)在保护一份秘密文件的任务中被神秘组织追杀，并且被其逮捕。当他再次苏醒后，发现自己被关押在一艘巨型潜艇中。除了维勒以外，这艘潜艇上还有同时被关押在隔壁的德国囚徒马尔科(道夫·龙格尔饰)以及自己的恩师爱德华、女见习生凯茜和雇佣兵首领金斯利。他们之中谁是盟友，谁是敌人?为了保护情报安全并且自证清白，维勒必须在乱局中认清敌人和盟友，保住性命逃出这座在深海中游荡的活坟墓。
《深海越狱》在曝光的预告片中,随着预告片中的血战拉开帷幕，中情局特工维勒（尚格·云顿 饰）被捕入狱，恩师的警告一直萦绕在他的心头——“你必须找到办法活下去，活到有机会翻盘！”深海的黑狱中，随着枪声的响起，尚格·云顿遭到严刑逼供，直至特工马可（杜夫·龙格尔饰）向他伸出了援手。
《深海越狱》的故事背景设定在深海中的一座核潜艇中，这座核潜艇被改造成了一座CIA的黑狱。与现实世界中臭名昭著的恶魔岛、博雅堡垒类似，监狱周围全是海。更夸张的是，高科技的装备和反越狱手段将各显神通，囚犯想要逃出生天，基本是不可能的事情。
危机四伏的黑狱、无法逃出的深海，这两个至关重要的问题如阴影般笼罩着两位特工。再加上暴力审讯，暗杀潜伏，而陷害他们入狱的U盘里究竟藏有什么重要信息？迷雾重重，连环烧脑。只有双雄共同出击，才能解决这一次的危机。两位特工将打破深海黑狱无法翻越的神话，联手战斗，打败一切阻挡他们重获自由的敌人。
高概念的深海背景设定、幽闭复杂的密室设计、酣畅淋漓的打斗场面、好莱坞巨星的联手对战以及烧脑不止的悬疑叙事，都是《深海越狱》的看点。