大家好，我是邓飞，这里介绍一下如何使用Haploview进行单倍型的分析。
计划分为三篇文章：
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第一篇：Haploview做单倍型教程1--软件安装 -
第二篇：Haploview做单倍型教程2--分析教程 -
第三篇：Haploview做单倍型教程3--结果解读
今天是第一篇。
下面是Haploview做的结果：
下面是LDblockShow做的结果：
两者结果是一致的。
Haploview因为是GUI界面，可以鼠标点点点的形式，所以更简单：
1. 软件下载
「官网：」 https://www.broadinstitute.org/haploview/downloads#JAR
「windows系统：」
「Linux系统：」
2. 配置java环境
https://www.java.com/zh-CN/download/
下载安装好之后，在终端运行java，出现帮助文档，说明配置成功。
2.1 windows系统
cmd终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。
2.2 Linux系统
终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。
3. windows安装
安装好之后，打开HaploView软件：
打开软件：
4. Linux安装
终端下，键入命令：
java -jar Haploview.jar
出现界面：
上面就是搞定了软件的安装。
下一篇介绍一下数据分析实操方法。
下下一篇介绍Haploview结果如何解读及如何微调结果。
欢迎继续关注。
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