文章题目
VCF2PopTree: a client-side software to construct population phylogeny from genome-wide SNPs
完成单位
The University of the Sunshine Coast
发表的时间是 2019 年12月份
发表的期刊是 PeerJ
PeerJ的影响因子是2.216
中科院分区生物3区
基本功能
直接上传vcf格式的变异文件，最后得到树文件
网页端工具，编写语言是JavaScript，这里想到一个笑话：
问：JavaScript和Java是什么关系？
答：是周杰和周杰伦的关系
问：那周杰和周杰伦是什么关系呢？
答：没有关系！
哈哈哈。。。扯远了
工具可以直接下载，在自己浏览器端打开就可以使用，
下载链接是
https://github.com/sansubs/vcf2pop
VCF2PopTree.html
这个文件直接使用浏览器打开就可以使用
可以上传压缩的vcf文件（.gz）或者没有压缩的vcf文件
还可以根据质量值（quality score）和覆盖度（coverage depth）对vcf文件进行过滤
两个计算距离的方法
三个模型
两个建树的方法 UPGMA tree 和 Neighbour-Joining tree (Unrooted)
两种展示树的方法
普通的矩形和环形
可以将最终得到的树的文本文件输出
最开始打开界面没有下方有一个红色按钮上面并没有字，需要先上传vcf文件，上传好以后红色按钮上才会显示出Draw的黄色字样。点击Draw就可以显示出图片。
下面是用示例文件生成的结果
可以生成这个树文件，但是没有下载图片的按钮
目前想到的用法是：如果拿到一个vcf文件可以初步用这个程序来看一下。如果真的用来建树的话应该不会用到。
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