R语言ggplot2科研数据可视化推文合集~看这些可能会有帮助（整理于2021年9月30号）

小明的数据分析笔记本公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！

R语言ggplot2数据可视化相关

• 1、R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配

• 2、R语言画三维散点图展示主成分分析（PCA）的结果

• 3、R语言ggplot2数据可视化之图中嵌图

• 4、R语言ggplot2可视化展示我国第七次人口普查的基本数据~人口总量和地区分布

• 5、R语言ggplot2分组箱线图(boxplot)添加显著性标记简单小例子

• 6、R语言ggstar包：给散点图的形状提供更多的选择

• 7、R语言pheatmap画热图遇到的一个报错及原因

• 8、R语言ggplot2画棒棒糖图展示中国十大姓氏

• 9、R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据

• 10、可能会用到的30个R语言包~第四期

• 11、R语言ggplot2折线图(line plot)添加置信区间（CI）展示学术论文作者数量的变化趋势

• 12、R语言ggplot2绘制经验累积分布(empirical cumulative distribution)曲线的简单小例子

• 13、R语言ggplot2画小提琴图（violin plot）展示学术论文作者数量

• 14、R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子

• 15、R语言的ggplot2做共线性结果可视化的第一篇笔记

• 16、R语言maftools包画oncoplot(瀑布图)的一个简单小例子

• 17、Circoletto可视化Blast结果的简单小例子

• 18、R语言做主坐标分析（PCoA）的一个简单小例子

• 19、答读者问：R语言ggplot2如何给坐标轴添加表示分组的线段

• 20、R语言ggplot2使用geom_label()函数添加文本标签的一些细节调节

• 21、R语言circlize包画一幅好看的弦图~完整示例数据和代码

• 22、ggplot2作图共享图例方法一：ggpubr包的ggarrange()函数以及调整图例的布局

• 23、R语言fmsb包画雷达图（radar plot）的一个简单小例子

• 24、ggplot2画点和分组椭圆展示主成分分析（PCA）结果的简单小例子

• 25、ggplot2画点和连线展示主成分分析的结果简单小例子

• 26、R语言ggplot2分组的小提琴图加箱线图简单小例子

• 27、答读者问：R语言ggplot2绘制热图展示GO富集分析结果的简单小例子

• 28、R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子

• 29、R语言ggplot2科研数据作图配色的一些小技巧

• 30、使用R语言的TCseq包分析基因表达的时间趋势并划分聚类群

• 31、使用R语言的Mfuzz包进行基因表达的时间趋势分析并划分聚类群

• 32、R语言ggplot2画带有弧度的线段简单小例子

• 33、R语言ggplot2画点和连线展示Mantel检验的结果~示例数据和代码可以获取

• 34、惊艳 | RStuido server选择不同的R版本（conda中的不同R版本）

• 35、R语言ggplot2画右三角方块热图的简单小例子

• 36、杂记：ggpairs更改配色；ggplot2极坐标添加直线；seqkit计算fasta序列的长度和gc含量

• 37、答读者问：R语言ggplot2散点图实现用箭头两两配对

• 38、R语言ggplot2做云雨图的简单小例子

• 39、R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程的简单小例子

• 40、R语言ggtree画圆形树的时候增加中心的空白区域

• 41、使用R语言的export包的时候遇到的报错和解决办法

• 42、R语言ggplot2绘制带有底纹的柱形图~patternplot扩展包

• 43、R语言ggplot2绘制平滑曲线的折线图简单小例子

• 44、R语言计算两组数据变量之间的相关系数和P值的简单小例子~应用于lncRNA的trans-act

• 45、剑桥大学单细胞课程学习笔记001~示例数据下载

• 46、R语言ggplot2气泡图叠加图片的简单小例子

• 47、R语言ggtree画聚类树图的时候的报错和解决办法

• 48、R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

• 49、R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

• 50、R语言ggplot2实现环形热图的简单小例子

• 51、R语言ggplot2绘图时如何在图形中使用数学表达式作为标注文本

• 52、R语言单、双因素方差分析及结果可视化的简单小例子

• 53、R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

• 54、R语言ggplot2画一幅漂亮的哑铃图

• 55、R语言实现评估随机森林模型以及重要预测变量的显著性

• 56、R语言randomForest包的随机森林分类模型以及对重要变量的选择

• 57、R语言ggplot2画金字塔图展示人口结构

• 58、R语言做t-SNE降维的一个简单小例子

• 59、R语言tidyverse包使用杂记：删除行、设置因子水平、指定列小写转大写

• 60、R语言操作otu丰度表：分行列计算平均和标准差
  

• 61、R语言ggplot2优雅的自定义分面轴刻度
  

• 62、R语言ggplot2分组箱线图添加误差线的简单小例子
  

• 1、跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画曼哈顿图展示XP-CLR score

• 2、跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画基因结构示意图

• 3、跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图

• 4、跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic

• 5、跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2散点图展示PCA结果

• 6、跟着Nature Genetics学二代测序数据分析：使用NOVOPlasty组装生菜的叶绿体基因组

• 7、跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画地图并且叠加饼状图的简单小例子

• 8、跟着Nature Medicine学画图：R语言画堆积柱形图以及时间格式数据做坐标轴的操作

• 9、跟着Nature Medicine学画图：R语言散点图组合频率分布图的简单小例子

• 10、跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2画小提琴图

• 跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画图如何让坐标轴以科学计数法显示11、跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2散点图并添加拟合曲线和置信区间

• 12、跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2+ggtree+aplot画气泡图组合聚类树图

• 13、跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2画气泡图（dotplot）展示基因表达量

• 14、跟着Nature Methods学画图：R语言画热图（pheatmap）展示基因表达量

• 15、跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言做方差分解的一个简单小例子

• 16、跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画图如何让坐标轴以科学计数法显示

• 17、跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画柱形图如何让屁股朝右

• 18、跟着Cell学作图：R语言ggplot2做蜂群图的简单小例子

• 19、跟着Science学画图:R语言ggplot2实现图中嵌图

• 20、跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画点和连线展示群体间Fst值和群体内Pi值

• 21、跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言ggplot2作图展示方差分解的结果

• 22、跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分面的堆积柱形图，有点类似展示群体结构k的那个图

• 23、跟着Science学画图：python的seaborn模块画下三角热图

• 24、跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分组添加拟合曲线

• 25、跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图

• 26、跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画图展示SNP位点的碱基类型

• 27、跟着Nature Communications学画图：R语言circlize包画弦图展示基因密度

• 28、跟着Gut学画图：R语言ggtree包画弦图的简单小例子