今年我们参加双11的课程为《基因学苑生物信息VIP课程第2季》已经全部更新完成。本次拿出课程诚意十足，包含五个专题，一共290节生物信息课程，全长超过200多小时，30多万文字讲义，大量PPT，10000多行代码，是学习生物信息非常好的材料。更重要的是配有半年云服务器上机操作。为了让更多人能够学习到我们的课程，今年双十一我们将提供更大折扣优惠，历史最优惠，全年仅一次。
活动介绍
3900元= 290集加密视频 + 6个月上机操作+文字讲义+PPT+案例代码+微信答疑群
1、课程包含五个专题，分别是宏基因组，RNAseq和单细胞，基因组数据分析，R语言和python数据分析；
2、提供本地版加密视频，加密视频仅在一台设备上播放，支持windows系统和苹果电脑 ，视频有效期至2027年12月31日；
3、包括6个月上机操作，服务器内包含上课全部案例数据和代码，可配合视频快速学习；
4、包含课程配套30万字讲义，大量PPT，10000+案例代码；
5、加入微信答疑群；
6、活动有效期，2023年10月29日 - 2023年11月12日；
7、可开具发票，具体发票请添加下面微信。
如何购买
1、渠道一：
添加下面微信，转账付款，发送下载地址，进行课程解锁，获取账号，开发票等事宜。
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课程目录：
专题名
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课程名 |
课程目录
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专题一：
宏基因组数据分析
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课程1： 生物信息基础 |
1-课程介绍
2-生物信息入门
3-熟悉Linux
4-登录服务器
5-传输文件
6-命令行操作
7-目录结构
8-文件操作
9-查看文件
10-截取文件
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12-文件编辑
13-脚本
14-权限管理
15-进程管理
16-生物软件安装
17-生物软件简介
18-虚拟环境
19-数据库下载
20-批量下载数据
21-测序数据下载
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课程2：
二代宏基因组
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22-宏基因组简介
23-宏基因组建库测序
24-建库
25-测序
26-fastq文件处理
27-数据质控
28-数据过滤
29-循环操作
29-物种分类原理
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30-利用kraken2物种分类
验
31-kraken2结果处理
32-批量生成脚本
33-解决软件报错
34-批量质控过滤
35-二代测序病原微生物鉴定
36-krakentools
37-megan可视化结果
38-利用stamp进行统计检
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课程3：
三代纳米孔宏基因组
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39-纳米孔测序简介
40-纳米孔测序原理
41-basecalling
42-利用guppy进行碱基识别
43-纳米孔测序数据质控过滤
44-纳米孔测序在宏基因组中应用
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45-centrifuge建立索引
46-三代宏基因组物种分类
47-物种分类结果可视化
48-新冠病毒鉴定
49-aws数据下载
50-临床病原微生物检测
51-批量鉴定
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课程4：
宏基因组拼接
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52-宏基因组模拟数据拼接
53-拼接结果评估
54-宏基因组真实数据拼接
55-不同拼接软件结果比较
56-三代宏基因组拼接
57-纳米孔拼接结果优化
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58-最新Q20纳米孔宏基因组拼接
59-cd-hit去冗余
60-宏基因组功能注释
61-salmon定量
62-metawrap配置
63-metawrap案例
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课程5：
16S数据分析
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64-扩增子测序简介
65-OTU还是ASV？
66-alpha和beta多样性
67-16S分析环境搭建
68-metadata
69-探索16S序列
70-qiime2简介
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71-qiime2导入数据
72-qiime2实战
73-多样性分析
74-物种分类鉴定及可视化
75-不同组间丰度差异比较
76-16S功能分析
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专题二：
RNAseq
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课程6：生物信息入门
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1-登录服务器
2-传输文件
3-基本命令
4-文件操作
5-文件操作2
6-选项参数
7-数据流
8-文件打包压缩
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9-编写脚本
10-权限管理
11-安装bioconda
12-安装生物软件
13-虚拟环境
14-FTP数据下载
15-SRA测序数据库简介
16-SRA数据下载
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课程7：R语言入门
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17-R语言简介
18-rstudio介绍
19-R包管理
19-碱基识别
20-bioconductor项目介绍
21-R使用
22-R读取文件
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23-R写入文件
24-R数据结构
25-向量
26-矩阵和数据框
27-数据处理
28-数据探索
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课程8：RNAseq
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29-RNAseq简介
30-RNAseq原理
31-RNAseq建库测序
32-star建立索引
33-数据处理
34-生成表达矩阵
35-DESeq2读入文件
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36-DESeq2数据探索
37-差异表达基因计算
38-差异表达基因分析练习
39-利用edgeR分析RNAseq
40-基因功能注释
41-非模式生物功能注释以及GSEA分析
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课程9：
单细胞
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42-单细胞测序概述
43-单细胞测序原理
44-单细胞分析环境搭建
45-准备数据
46-cellranger结果解读
47-LoupeBrowser可视化单细胞数据
48-Seurat读取数据
49-Seurat分析单细胞数据
50-寻找marker基因及细胞鉴定
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51-Seurat练习
52-CellMarker注释
53-SingleR自动化细胞注释
54-单细胞分类注释练习
55-monocle3读取数据
56-利用monocle3分析单细胞数据
57-拟时分析
58-空间转录组
59-购买云服务器
60-生物信息分析平台搭建
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专题三：
基因组数据分析
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课程10：
生物信息基础
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1-课程介绍以及登录服务器
2-传输文件以及网络测试
3-目录结构
4-文件操作
5-查看文件
6-文件打包压缩
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7-文件编辑
8-运行脚本
9-bioconda安装
10-bioconda管理软件
11-虚拟环境
12-配置nature文章环境
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课程11：
二代基因组拼接
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20-fastq文件简介
21-数据质控
22-数据过滤
23-基因组拼接简介
24-基因组拼接原理
25-kmer估计基因组大小
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26-拼接基因组
27-拼接结果评估
28-quast评估
29-busco评估
30-常见问题
31-基因组拼接探索
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课程12：
三代基因组拼接
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32-pacbio测序原理
33-pacbio数据处理
34-pacbio拼接
35-进程管理
36-纳米孔测序原理
37-纳米孔建库测序
38-basecalling
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39-纳米孔测序数据处理
40-纠错原理
41-pilon纠错
42-racon纠错
43-tablet结果可视化
44-pacbioHifi拼接
45-纳米孔Q20试剂拼接
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课程13：
基因组分析
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46-原核生物基因预测
47-真核生物基因预测
48-基因功能注释
49-查看结果以及在线注释
50-rRNA分析
51-tRNA分析
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52-重复序列分析
53-RepeatMasker查找重复序列
54-blast比对
55-氨基酸blast比对
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课程14：
人基因组变异检测
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56-人基因组变异检测
57-突变类型
58-人基因组分析环境搭建
59-Apptainer安装软件
60-参考序列以及数据库下载
61-瓶中基因组计划
62-变异检测原理
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63-sam格式文件处理
64-比对结果统计
65-利用DeepVariant检测snp
66-vcf文件处理
67-纳米孔测序SV检测
68-igv可视化突变数据
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专题四：
R语言
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课程15：
R语言入门
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1-R语言简介
2-R分析环境搭建
3-R基本操作
4-R函数
5-R自定义环境
6-R包管理
7-bioconductor包管理
8-读写文件
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9-读写excel以及R文件
10-数据结构
11-向量索引
12-矩阵
13-绘制热图
14-数据框
15-因子列表以及缺失数据
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课程16：
数据处理以及统计检验
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16-数据转换
17-随机抽样
18-排序筛选
19-数据探索
20-独立性检验
21-t检验
22-相关性检验
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23-tidyverse
24-获取免费在线R环境
25-整洁数据
26-dplyr处理数据
27-字符串处理
28-线性回归
29-回归诊断
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课程17：
R语言绘图
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30-R绘图基础
31-绘图参数
32-绘图结果编辑
33-散点图
34-克利夫兰点图
35-火山图
36-折线图
37-直方图
38-饼图以及条形图
39-箱线图及小提琴图
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40-韦恩图及绘图布局
41-ggplot2绘图
42-ggplot2绘制散点图
43-ggplot2直方图与条形图
44-ggplot2饼图箱线图
45-自定义主题
46-ggplot2扩展
47-文字云图
48-曼哈顿图桑基图以及圈图
49-地图
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课程18：
R数据分析
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50-方差分析
51-主成分与因子分析
52-聚类分析
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53-分类分析
54-购物篮分析
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课程19：
R高级技能
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55-循环
56-判断
57-自定义函数
58-命令行选项参数
59-quarto编写文档
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60-markdown代码
61-shiny动态报告
62-shiny案例
63-R包开发
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专题五：
python数据分析
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课程20：python数据分析
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1-python数据分析简介
2-安装Anaconda3
3-安装配置vscode
4-使用ipython
5-使用jupyter
6-python模块管理
7-python模块使用
8-读取文件
9-写文件
10-numpy数据结构
11-Seris数据结构
12-数据框
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13-数据索引
14-修改以及排序
15-筛序以及抽样
16-数据透视表
17-长宽数据转换以及缺失值
18-独立性检验
19-t检验
20-相关性检验
21-python绘图
22-机器学习
23-Quarto撰写文档
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配套材料
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配套材料
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课程文字讲义，案例代码脚本，课程PPT，配套阅读材料
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上机操作云服务器
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配置大小
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共享云服务器，256线程，1T内存，1T磁盘，完成视频中全部案例操作
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上机操作
常见问题：
1、上机操作服务器是什么？
2、课程是否适合零基础？
课程是《基因学苑VIP课程第2季》全部内容，额外加python数据分析专题，相当于43天培训的全部内容。里面包含了生物信息基础，Linux，生物软件管理，R，python，二三代测序原理等基础内容，还包括RNAseq，单细胞，宏基因组，16S，人基因组变异检测等应用内容。适合零基础从头开始学习。
3、是否能只购买课程一部分？
本课程为打包销售，不单独售卖。
4、想在多台设备播放怎么办？
课程为本地加密版本，只能在一台电脑设备上播放，windows系统和苹果系统均可，不支持手机端播放，也不支持录屏。因为视频内容很大且里面有很多操作演示，不适合手机端播放。默认只支持一台设备，如果想多台设备播放，每台加1000元。
5、课程可以看多久？
课程有效期到2027年12月31日。
6、该课程与B站的课程有哪些区别？
B站课程不提供上机操作，不提供微信群，不定期更新，本课程可一次获取全部内容。
7、如何进行解锁？
视频需要使用专用播放器进行播放，下载播放器，导入任何一个视频，将下图1所示的机器码发给我即可进行解锁，然后将解锁码填入图中2部分即可，一次解锁即可观看全部内容。
8、是否可以开发票
本教程提供发票，发票为电子发票，具体信息可添加上面微信进行咨询。