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生物信息学入门~在购买的云服务器上安装anaconda3用于常用的软件安装

生物信息学入门~在购买的云服务器上安装anaconda3用于常用的软件安装 小明的数据分析笔记本
2024-05-16
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云服务器购买链接(复制链接电脑端打开)

https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.11533457&userCode=3enjgk6n

2核2G 40G存储空间

在生物信息学中,通常需要处理各种各样的组学数据,处理这些数据通常需要安装对应的数据处理软件。在linux系统上安装软件相对比较麻烦。anaconda3 解决的就是安装软件的问题。把anaconda3软件安装基本上90%以上的生物信息学数据处理软件都可以安装

anaconda3 的下载链接 https://www.anaconda.com/download

image.png

在这个页面点击 skip registration 进入下载界面

image.png

点击下滑线处的连接就可以,下载好以后可以通过xftp的软件 将下载好的安装包上传到云服务器

或者用xshell软件连接云服务器,使用wget的命令来下载

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh

阿里云这个云服务器下载速度还是挺快的

安装anaconda3用如下命令

bash Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh
image.png

出现这个界面以后就一直按回车键

image.png

出现这些内容就按键盘上的 q 键

image.png

出现这个界面输入yes

image.png

出现这个界面就按回车键,就会进入安装状态,可能需要一些时间,我们等待

image.png

进入这个界面输入yes ,安装完成

然后退出登录,重新进行登录

登录以后再输入命令的地方最前面会多出一个 (base)  ,这就说明安装好了

如果我们想安装某个软件,可以首先用conda search 命令搜索一下这个软件在anaconda中是否存在

比如转录组数据处理中经常用的比对软件hisat2

conda search hisat2 -c bioconda

如果这个软件有的话就会列出软件的版本

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