当前,新冠肺炎疫情肆虐全球,严重威胁人民健康和社会发展。为更好应对新冠肺炎等新发传染病,充分挖掘利用疾病或健康时空监测数据,进一步提升疾控人员和科研工作者对数据的时空分析方法和可视化技术,广东省公共卫生研究院环境与健康研究室于2020年8月3日- 8日以现场面授和线上直播两种形式同时开展了为期六天的“新冠肺炎专题数据分析及可视化”培训班。来自不同省市区疾病预防控制中心、医院及高等院校等120多名学员参加了本次培训班。
因新冠肺炎影响,本次培训班采取了现场面授和线上直播两种形式。为方便广大学员参与,本次培训于“腾讯课堂”以在线直播形式进行授课。同时为了切实做好新冠疫情防控工作,通过出示“粤康码”、上课全程佩戴口罩、体温监测等具体措施保障了本次培训活动现场安全有序地开展。
本次培训班由环境与健康研究室刘涛博士和肖建鹏博士共同主持,马文军院长出席培训班开幕致辞并作《大数据在新冠肺炎疫情防控中应用》报告。环境与健康室的刘涛、肖建鹏、何冠豪、胡建雄、龚德鑫、王嘉琪、孟浩蓉参与了培训讲课。本次培训班课程基于 R 语言讲解数据处理及分析方法,介绍典型案例,强化实践操作,主要课程包括了大数据在新冠肺炎疫情防控中应用、R 语言基础及数据整理技术、传染病的基本再生数(R0)和实时再生数(Rt)计算方法及应用、疫情预测预警和风险评估的分析:广义相加模型(GAM)的建模策略及应用、SIR 和 SEIR 动力学模型建模方法及其在疫情预测和防控效果评估中的应用、监测数据可视化:时间序列数据可视化(基础时序图、流式图、热力图等),网络关系数据可视化(社交网络关系图、桑基图、传播路线地图),空间数据可视化(疫情分布地图、基于 Leaflet 网页交互地图)。
授课教师在课堂上将理论基础、案例分析和上机实操演练进行有机结合,基于R语言基础,针对新冠肺炎及其他疾病或健康时空监测数据的处理,结合时间序列模型、空间技术的应用和可视化方法,深入浅出地讲解了如何基于R软件进行监测数据的时空分析和可视化。本次培训班重视理论基础和实操演练,理论结合实际,将对数据的时空分析方法和可视化简易化,同时解答了学员的疑问,现场气氛活跃,受到了学员的一致好评。通过此次培训,有效提高了学员使用R语言进行数据处理的能力,对数据的时空分析方法和可视化技术有了系统的了解,为有效利用疾病或健康时空监测数据进行现场防控和科学研究奠定基础。

图1. 马文军院长作《大数据在新冠肺炎疫情防控中应用》的报告

图2. 讲师风采

图3. 讲师风采

图4. 培训现场答疑

图5. 培训现场

