论文

PSAURON: a tool for assessing protein annotation across a broad range of species

https://academic.oup.com/nargab/article/7/1/lqae189/7944703

工具对应的github主页

https://github.com/salzberg-lab/PSAURON

直接用pip安装，安装挺方便的，用55000个基因测试了一下，运行速度也挺快的

期刊

我是在论文

https://www.biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/2025.08.14.670405

Evolutionary and methodological considerations when interpreting gene presence-absence variation in pangenomes

2025.08.14.670405v1.full.pdf

中看到的这个工具，这篇论文主要讨论泛基因组分析中注释方法对基因存在缺失变异分析结果的影响，主要讨论的是棉花和大豆。论文中对应的分析代码都有

https://github.com/tomasbruna/pangene-pav-integration

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