❝本节来介绍一款R包「DrugSim2DR」，可以计算DEscore、药物功能相似性、绘制化合物的化学结构等功能;下面来介绍该R包的一个小例子
❞
官方文档
❝https://cran.r-project.org/web/packages/DrugSim2DR/vignettes/DrugSim2DR.html
❞
❝❞
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安装R包
BiocManager::install("ChemmineR")
install.packages("DrugSim2DR")
library(DrugSim2DR)
library(ChemmineR)
library(rvest)
绘制化合物结构图
plotDrugstructure("DB01050")
plotDrugstructure("DB00780")
可以通过下方网址检索化合物的「DrugBank Accession Number」https://go.drugbank.com/drugs
计算药物-药物功能相似性
GEP<-Gettest("GEP")
label<-Gettest("label")
# Calculate the zscore
DEscore<-CalDEscore(GEP,label)
drug_similarity<-DrugSimscore(DEscore,nperm = 0)
###view first ten drugs result
drug_similarity[1:5,]
drug1 drug2 drug1_name drug2_name similarity
5296 DB02721 DB01213 4-Iodopyrazole Fomepizole 17.262882
5384 DB02757 DB02721 Pyrazole 4-Iodopyrazole 5.749231
5413 DB02757 DB01213 Pyrazole Fomepizole 5.130445
7181 DB04820 DB00780 Nialamide Phenelzine 3.298942
7288 DB04832 DB00780 Zimelidine Phenelzine 3.298942
❝好了本节介绍到此结束，此款R包还有更多的功能，更多详细的内容请参考作者官方文档，
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