欢迎关注R语言数据分析指南
❝最近有读者询问代谢物富集分析的内容，小编在2022年写过此类相关内容。已经过去了3年注释数据集已经有了变化，本节来重新更新一下该部分内容。个人观点仅供参考，数据为随意构建无实际意义详细的代码及介绍文档稍后会上传交流群内，有需要学习R语言绘图的朋友，可关注文末介绍购买小编的R绘图文档。购买前请咨询，零基础不要买。
文件介绍
富集分析总共需要三个文件，kegg 数据库注释文件，代谢通路背景文件，差异代谢物编号。代谢物注释文件做代谢组业务后公司会提供，因此前期需要准备的只有注释文件。此文件可通过代码从kegg网站上下载即可，目前有578个pathway。
注释数据库下载
上面pathway.list文件显示有578个，因此成功执行下方代码后，文件夹内总结有580个文件，map.txt则是最终所需的文件。
# 下载 pathway 列表
wget -c -O pathway.list http://rest.kegg.jp/list/pathway
# 提取所有 pathway ID，并下载对应的 compound 信息（并发 5 个任务）
cat pathway.list | cut -f1 | xargs -n1 -P5 -I{} wget -c -O {}.txt http://rest.kegg.jp/link/compound/{}
# 合并所有下载的文件为 map.txt，然后删除中间文件
cat map*.txt > map.txt
背景文件合并正负离子注释结果文件即可，差异代谢物则通过差异分析结果可获得。需要注意注释文件中是否有多余字符，若有进行修整即可，因此准备好上述三个文件后即可进行如下基础的数据可视化。
结果图
关注下方公众号下回更新不迷路
购买介绍
❝本节介绍到此结束，有需要学习R数据可视化的朋友欢迎到淘宝店铺：R语言数据分析指南，购买小编的R语言可视化文档，2025年购买将获取2025年更新的内容，同时将赠送2024年的绘图文档内容。
更新的绘图内容包含数据+代码+注释文档+文档清单，小编只分享案例文档，不额外回答问题，无答疑服务，更新截止2025年12月31日结束，零基础不推荐买。
案例特点
❝所选案例图绝大部份属于个性化分析图表，数据案例多来自已经发表的高分论文，并会汇总整理分享一些论文中公开的分析代码。
2025年起提供更加专业的html文档，更加的直观易学。文档累计上千人次购买拥有良好的社群交流体验，R代码结构清晰易懂.
目录大纲展示
群友精彩评论
淘宝店铺
2025年更新案例图展示
2024年案例图展示
